Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pramef12Q9D2F1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pramef12Q9D2F1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms