Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nol3Q9D1X0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nol3Q9D1X0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms