Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf4Q9D1H6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufaf4Q9D1H6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufaf4Q9D1H6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms