Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ube2cQ9D1C1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms