Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Syf2Q9D198 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms