Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ccdc167Q9D162 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc167Q9D162 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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