Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem88Q9D0N8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Tmem88Q9D0N8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Tmem88Q9D0N8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem88Q9D0N8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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