Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2e1Q9D0D5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms