Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3bQ9CZT8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms