Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shisa9Q9CZN4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shisa9Q9CZN4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms