Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnajc18Q9CZJ9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnajc18Q9CZJ9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms