Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rrs1Q9CYH6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rrs1Q9CYH6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms