Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ChtopQ9CY57 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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