Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx7Q9CY18 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx7Q9CY18 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms