Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exo5Q9CXP9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exo5Q9CXP9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms