Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd4Q9CWX4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpusd4Q9CWX4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpusd4Q9CWX4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rpusd4Q9CWX4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms