Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pfdn1Q9CWM4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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