Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psma8Q9CWH6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psma8Q9CWH6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms