Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sft2d3Q9CSV6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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