Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gnpda2Q9CRC9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gnpda2Q9CRC9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms