Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exosc5Q9CRA8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms