Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkiras2Q9CR56 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms