Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klhl28Q9CR40 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Klhl28Q9CR40 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms