Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1bQ9CQC9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sar1bQ9CQC9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms