Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Q9CQC3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q9CQC3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q9CQC3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms