Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700129C05RikQ9CQ77 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700129C05RikQ9CQ77 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms