Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pole4Q9CQ36 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms