Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp3Q9CQ10 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chmp3Q9CQ10 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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