Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl17Q9CPR4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl17Q9CPR4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms