Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim3Q99PE5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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