Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SrrtQ99MR6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms