Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pink1Q99MQ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pink1Q99MQ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms