Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PccbQ99MN9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PccbQ99MN9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PccbQ99MN9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PccbQ99MN9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms