Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gtpbp4Q99ME9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms