Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd3Q99LY2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd3Q99LY2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms