Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clp1Q99LI9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clp1Q99LI9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms