Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf2Q99LE6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms