Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pagr1aQ99L02 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms