Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clint1Q99KN9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clint1Q99KN9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms