Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmed9Q99KF1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmed9Q99KF1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms