Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lims1Q99JW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lims1Q99JW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms