Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krcc1Q99JT5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms