Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Def8Q99J78 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms