Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Apobec3Q99J72 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms