Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ctu1Q99J10 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ctu1Q99J10 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ctu1Q99J10 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ctu1Q99J10 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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