Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms