Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sntg1Q925E1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sntg1Q925E1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms