Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prss28Q924N9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prss28Q924N9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms