Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gtpbp3Q923K4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gtpbp3Q923K4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtpbp3Q923K4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gtpbp3Q923K4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtpbp3Q923K4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms