Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb6Q922F4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb6Q922F4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms